Masjid Menara Kudus berada di Desa Kauman, Kecamatan Kota, Kabupaten Kudus, Jawa Tengah. Didirikan oleh Sunan Kudus, masjid tersebut sebelumnya diberi nama Masjid Al Aqsa. Ini tercatat dalam sebuah prasasti yang terpasang di bagian atas mihrab. Tulisan pada batu yang berperisai itu menyebut bahwa masjid itu bernama Masjid Al Aqsha di Negeri Al Quds.

Seperti dikutip dari viva (20/6/2015), berdasarkan cerita, batu tersebut berasal dari Baitulmakdis (Al Quds) di Yerussalem, Palestina. Dari kata “baitulmakdis” itulah muncul nama Kudus yang artinya suci, sehingga masjid tersebut dinamakan masjid Kudus dan kotanya dinamakan dengan kota Kudus. Selain itu ada banyak simbol toleransi di dalam Masjid Kudus ini.