Au début du XXe siècle, quand trois enfants emmènent leur bétail paître dans les environs de Fatima, une petite ville du centre du Portugal, rien ne laisse présager qu'ils vont être témoins d'une apparition extraordinaire. Pourtant, c'est bien la Vierge Marie qui se présente devant ces bergers éberlués. Encore sous le choc de cette vision, ils s'empressent d'aller conter en ville ce qu'ils viennent de vivre. Ravis de se trouver à proximité d'un tel miracle, les nombreux croyants s'extasient de la nouvelle, ce qui est loin d'être le cas des autorités religieuses, fortement remontées contre ce soudain regain de popularité...