Mary-Katherine, une adolescente, ne cache pas son scepticisme à son père, le professeur Bomba, sur les chances de réussite de ses recherches scientifiques. Elle ne croit pas qu'il pourra jamais prouver l'existence de soldats miniaturisés. Tous deux ignorent pourtant que ces nains combattants existent et vivent tout près d'eux. Les Leafmen ont en effet pour mission de protéger la forêt des entreprises maléfiques des Boggans, de diaboliques créatures, et de leur maître, le malveillant Mandrake. L'un des Leafmen, Nod, quitte la compagnie, parce qu'il désapprouve les choix de son chef, Ronin. Pendant ce temps, la reine de la forêt se cherche un héritier...