Il y a dix ans, l'humanité était menacée de tomber aux mains de l'Empire des ténèbres, mené par le diabolique docteur Hell. Aux commandes de son super robot Mazinger Z et avec l'aide de ses amis du laboratoire de recherches photoniques, Koji Kabuto déjouait les plans machiavéliques du mégalomane et ramenait la paix sur le monde. Désormais éloigné du pilotage, il est devenu scientifique. Il découvre une gigantesque structure enfouie profondément sous le mont Fuji, d'où semble provenir une forme de vie. Le docteur Hell ne semble pas avoir dit son dernier mot...