Un remède contre la condition mutante menace d'altérer le cours de l'histoire. Pour la première fois, les mutants ont le choix : conserver leur caractère unique responsable de leur isolement ou abandonner leurs pouvoirs et devenir humains. Les points de vue opposés des leaders mutants, le professeur Charles Xavier, qui prêche la tolérance, et Magneto, qui croit en la loi de plus fort, sont mis à rude épreuve et déclenchent une guerre titanesque